地下城堡2的副本系统是游戏核心玩法之一，包含多种类型，每种副本在进入条件、难度机制和奖励内容上均有显著差异。玩家需通过购买龙纹银币、制作仿制龙纹硬币等道具开启副本入口，部分副本如墓葬、远山庄园等需满足特定装备或属性要求。副本每日进入次数有限，失败后可消耗食物再次挑战，但需注意部分副本如裁判所存在永久性路线优化机制。
游戏副本按难度可分为初级、中级和高级三个层级。初级副本如远山庄园适合新手，敌人伤害较低但附带减速效果，需搭配祭祀角色稳定推进；中级副本如墓葬要求刺客技巧465以上且全队技巧315，需穿戴流血衣、瘟疫首饰等特殊装备；高级副本如裁判所和幽谷则需全员40+护甲、2800+血量及特定抗性数值。副本难度与奖励呈正相关，高级副本掉落转职材料、符文及高品质装备。
部分副本如墓葬采用分阶段设计，需先获取宝箱再挑战最终BOSS；幽谷副本需通过透镜击杀小怪收集魂魄；训练营副本则依赖烈酒道具开启。BOSS战存在特殊机制，如谢佛免疫嘲讽、兽人韦恩需打断技能，玩家需根据BOSS特性调整阵容技能配置，例如使用圣骑士手动晕眩或法师控制输出节奏。
推荐阵容通常包含圣骑、祭祀、法师和刺客/巫医组合，圣骑需承担嘲讽与治疗职责，祭祀负责群体恢复，刺客主攻流血伤害。装备选择上，铁壁符文甲、瘟疫项链、冰衣等能有效应对副本负面效果。属性方面需重点提升护甲、抗性、技巧等数值，例如祭祀技巧需达300以上以保证治疗效率。
副本奖励系统涵盖装备、材料和资源三类。专属掉落包括迅捷之靴、腐蚀之杖等特殊装备，转职道具如干枯之手、神仆笔记，以及符文和蓝图碎片。日常必刷副本如迷雾岛可获取装备碎片，裂隙副本产出高级资源。玩家可通过分解重复装备获取锻造材料，逐步提升队伍整体实力。
