少年三国志2和零作为同系列作品，核心差异在于玩法机制的颠覆性革新。少年三国志2延续了传统卡牌回合制框架，以武将收集、阵容搭配为核心，战斗采用自动回合制模式，强调角色养成与技能组合；而少年三国志零则彻底重构玩法体系，引入实时竞技与兵种克制机制，战斗需手动释放军师技能，结合4×4布阵实现战术微操。这种差异直接导致两款游戏的策略重心不同，前者偏向数值养成与羁绊组合，后者更注重即时操作与战场应变。
兵种系统是少年三国志零的独有设计，包含盾兵、步兵、轻骑、重骑、弓手和谋士六大类型，彼此存在明确的克制关系。例如轻骑能突袭后排远程单位，盾兵则专精防御保护队友，这种设计显著提升了战前布阵的策略深度。相比之下，少年三国志2的兵种仅作为武将属性存在，不影响实际战斗机制。零代还创新性地加入士兵系统，主将统率的小兵数量与质量直接影响战场表现，这种武将+士兵的双层架构在系列中尚属首次。
养成体系方面，少年三国志2采用线性成长模式，资源集中投入核心武将即可形成稳定战力。零代则因军师系统的加入变得更为复杂，需同步培养主将、士兵、军师三个维度，其中军师技能的手动释放时机直接影响战局走向。零代的流派组合打破了传统国家队限制，允许跨阵营武将形成特殊联动效果，这种设计大幅提升了阵容构建的灵活性，但也相应提高了入门门槛。
少年三国志2通过活跃任务和活动投放大量免费资源，零氪玩家能通过规划实现稳定发展；少年三国志零的养成素材获取则更依赖赛季制玩法，红将、红宝物等关键内容存在较高获取壁垒。两款游戏的社交体系也各有侧重，前者以军团协作为主，后者则强化跨服GVG玩法，问鼎中原等大型国战模式要求更高程度的组织配合。这种差异使得两款游戏分别适合不同类型的玩家群体。
少年三国志2更适合偏好轻松养成、享受阵容搭配乐趣的玩家，少年三国志零则针对追求实时操作与深度策略的硬核用户。选择时需综合考虑个人时间投入、操作偏好及战略思维倾向，两者在核心体验上已形成明显区隔。
